Pese a que la Universidad Cisneriana Complutense no se 'funda' hasta el 13 de abril de 1499, mucho antes en el tiempo, el 20 de mayo de 1293, el rey Sancho IV de Castilla había otorgado licencia al obispo toledano García Gudiel para crear el Studium General (como entonces se denominaban los estudios universitarios). Estos estudios, si bien de manera bastante modesta, pervivieron a través del tiempo hasta enlazar con la refundación cisneriana. Las últimas cátedras susbsistentes de aquellos Estudios Generales del siglo XIII, fueron integradas por Cisneros en la 'nueva' universidad. El encargado de emitir las bulas fundacionales del Colegio Mayor de San Ildefonso fue el Papa Alejandro VI, quien permite al Cardenal Cisneros fundar la institución, dotarla de todos los bienes materiales y económicos que fueran necesarios y le confiere oficialidad a los títulos expedidos por ésta.

Surge con su estatus actual en 1977, al producirse el fenómeno de descentralización universitaria y constituirse como universidad propia, abarcando diversos centros universitarios de la Universidad Complutense de Madrid establecidos en 1975 en el municipio alcalaíno, algunos de ellos ocupando instalaciones de la antigua Universidad Cisneriana.

Tras la supresión de la Universidad Cisneriana en 1836 y su traslado a Madrid, para constituir la Universidad Central, Alcalá se había quedado sin centros universitarios. Desde entonces, la aspiración de recuperación de la Universidad de Alcalá se mantuvo viva gracias a la Sociedad de Condueños, una asociación cívica alcalaína que adquirió algunos de los antiguos edificios de la Universidad Cisneriana. Durante el año 1975 se establecieron en Alcalá algunas facultades dependientes de la Universidad Complutense de Madrid a fin de descongestionarla. Dos años después, se creó, a partir de dichos centros, la actual la Universidad de Alcalá de Henares.

En la actualidad, su actividad se distribuye entre edificios singulares del casco urbano, en su mayoría antiguos conventos o colegios menores de la antigua universidad renacentista recuperados y rehabilitados, y los campus de Alcalá y Guadalajara.

Cuenta, entre otras, con las carreras de: Arquitectura, Biología, Ciencias Ambientales, Ciencias Económicas y Empresariales, Derecho, Documentación, Farmacia, Filología Hispánica, Filología Inglesa, Historia, Humanidades, Medicina, Química, Arquitectura, Geodesia, Ingeniería Informática, Ingeniería de Telecomunicación, Ingeniería Industrial, Arquitectura técnica, Enfermería, Fisioterapia, Magisterio y Turismo, además de varios títulos propios, másteres y estudios de doctorado.

Colegios históricos universitarios

El colegio Trinitarios.

Colegio Mayor de San Ildefonso (actual rectorado)

Colegio-Convento de Frailes Mínimos (actual Fac. de CC. Económicas)

Colegio Máximo de la Compañía de Jesús (actual Fac. de Derecho)

Colegio-Convento de Dominicos, de Santo Tomás (Parador Nacional)

Colegio-Convento de San Basilio (act. Aula de Música de la Universidad)

Colegio de Málaga (actual Facultad de Filosofía y Letras)

Colegio-Convento de Trinitarios Descalzos (act. Estudios Norteamericanos)

Colegio-Convento de San José de Caracciolos (actual Fac. de Filosofía y Letras)

Colegio del Rey (actual sede del Instituto Cervantes)

Colegio de Mena (desaparecido)

Colegio de Aragón (act. viviendas particulares)

Colegio de Manchegos (act. viviendas particulares)

Colegio de Lugo (actual comercio y viviendas)

Colegio de Sta. Catalina de Siena o de los Verdes (act. comercio y viviendas part.)

Colegio-Convento de Carmelitas Descalzos (act. en estado de abandono)

Colegio-Convento de Carmelitas Calzados (Escuela de Arquitectura)

Colegio de San Patricio (también de San Jorge) de Irlandeses

Colegio Franciscano de San Pedro y San Pablo (act. dependencias universitarias)

Colegio de San Jerónimo

Colegio de León (postgrado)

Fuente: Wikipedia